Lancet Oncol:肾透明细胞癌与老年人悖论相关的转录组特征分析

2022-01-24 01:54:26 来源:
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一.科学研究背景

很低血压与膀胱光亮巨噬细胞胰脏 (ccRCC)的很低风险减少有关,但很低血压又矛盾地与该的预后改善有关,其潜在选择性尚不确切。现原作者对很低血压病征和但会运动量病征在原发和疣周腺体中都的甲状腺转化和免疫mRNA组歧异顺利完成科学研究统计分析。

本文概述了基因序列表达引起的微环境的歧异有助于理解很低血压病征的生存环境优势(很低血压悖论)。

二.统计分析工序三.评论详述1.COMPARZ缓冲区、TCGA-KIRC缓冲区、MSK免疫疗法缓冲区数据收集、矫正

在COMPARZ缓冲区的453名病征中都,有375名(83%)病征有着最简单的微阵列数据,疗法前BMI精确测量以及无进展和相相当生存环境数据顺利完成统计分析(表1)。除119名(26%)增重病征外,来自COMPARZ试验的最后缓冲区包括256名(68%)病征(n=256)。

表1.COMPARZ临床研究试验缓冲区的人口统计学和临床研究特点

TCGA-KIRC缓冲区中都的332举例病征中都,评估了经膀胱切除拳法疗法的152举例(46%)晚期(即AJCC III和IV期)ccRCC病征的临床研究和人口统计学数据(表2)。在忽略59名(39%)增重病征后,最后获得的缓冲区包括93名病征(n=93)。

表2.晚期光亮巨噬细胞膀胱巨噬细胞胰脏TCGA-KIRC缓冲区的人口学和临床研究特点

从62举例MSK远处腺体缓冲区中都顺利完成膀胱脏切除拳法的非高血压光亮巨噬细胞RCC病征中都获得了原发性和远处碳水化合物样品。在这个缓冲区中都,从59名病征的PNN(膀胱周附近)远处碳水化合物,25名病征的PNA(远离膀胱周)远处碳水化合物以及55名病征的组织中都取样。在忽略增重病征后来,最后缓冲区包括41名(69%)PNN样本病征, PNA样本为17(68%),样本为37(67%)。从最初的203名参与者的MSK免疫疗法科学研究人群集中都忽略74名(36%)增重病征后,总生存环境统计分析的最后缓冲区包括129名(64%)参与者(表3)(n=129)。

表3. 采行MSK免疫疗法的临床研究试验缓冲区的人口统计学和临床研究特点

2.很低血压的膀胱光亮巨噬细胞胰脏病征近似于但会运动量的膀胱光亮巨噬细胞胰脏病征总生存环境期更长

根据KM生存环境统计分析,在三组中都都推断出很低血压病征的总生存环境期更长。在TCGA-KIRC缓冲区中都,经分期修正后,很低血压病征的相相当存活期长于但会运动量组;在COMPARZ缓冲区中都,经IMDC很低风险低分修正后,长相病征的相相当存活期也长于但会运动量组。在MSK免疫疗法缓冲区中都,经IMDC很低风险低分修正后,BMI与死亡率的无显著歧异(如由此可知1)。

由此可知1.TCGA-KIRC缓冲区 (A)、COMPARZ 缓冲区(B)和MSK免疫疗法缓冲区(C)的总生存环境期

3.COMPARZ缓冲区中都很低血压病征有着更多的PFS

对CPMPARZ缓冲区KM统计分析后,KM曲率推断,COMPARZ缓冲区中都很低血压病征比但会运动量病征有着更多的PFS。

由此可知S1.COMPARZ缓冲区中都很低血压病征比但会运动量病征有着更多的PFS

4.用作三线口服疗法,很低血压病征仍有着更多的OS

KM曲率推断了在用作三线丝氨酸趋化因子衍生物(pazopanib或Sunitinib)的两个疗法组中都,很低血压病征的OS仍然较但会运动量病征好。

由此可知S2.COMPARZ缓冲区用作三线口服疗法组的总生存环境期统计分析

5.COMPARZ缓冲区中都,很低血压与但会运动量的病征mRNA组基因序列特点发挥作用显著歧异

做完上述统计分析,原作者在三个缓冲区中都确认很低血压悖论发挥作用后来,最后在COMPARZ缓冲区中都对很低血压和但会运动量病征评估了mRNA组学歧异。再一做了Hallmark基因序列集的GSEA统计分析,相当很低血压病征与但会运动量病征二者之间的歧异:很低血压病征中都推断减压、TGF-β、黏膜-间充质转变和甲状腺转化回波简而言之显著挂钩,提示外伤愈合简而言之的激活(由此可知A)。由此可知B是对由此可知A筛选的几个基因序列表达简而言之的Enrichment plots。

由此可知S4.COMPARZ缓冲区中都很低血压病征与但会运动量病征的ccRCCmRNA组基因序列特点发挥作用显著歧异

6.COMPARZ缓冲区与TCGA-KIRC缓冲区 中都很低血压比但会运动量病征的甲状腺转化低分很低

在GESA为基础的特点基因序列集甲状腺转化低分相当中都,很低血压病征很低于但会运动量病征(如由此可知2)。

由此可知2.COMPARZ缓冲区(A)与TCGA-KIRC缓冲区 (B)中都很低血压原发病征与但会运动量病征的甲状腺转化的z score

7.但会运动量与很低血压病征的免疫系统群集无显著歧异

对但会运动量(7举例)与很低血压(16举例)病征的原发的主要免疫系统数量除此以外采行流式巨噬细胞拳法顺利完成评估。由此可知A推断了很低血压病征与但会病征二者之间的免疫系统群集的相相当歧异。由此可知B确切推断了很低血压和但会运动量病征T巨噬细胞群集的显现出来水准。推断出但会运动量与很低血压病征的免疫系统群集无明显歧异,免疫系统显现出来的程度与BMI无关。

由此可知S9.用流式巨噬细胞拳法统计分析但会运动量与很低血压病征的免疫系统群集无明显歧异

8.与但会运动量病征相比,很低血压病征疣周腺体发炎减少,尤其是附近的疣周碳水化合物

在MSK的非高血压ccRCC病征的前瞻性缓冲区中都,原作者合并了20个最显著的比较丰富的IPA标准化简而言之,这些简而言之来自于很低血压和但会运动量病征的PNN和PNA样本的相当(由此可知A)。很低血压和但会运动量病征的PNN和PNA样本二者之间的免疫显现出来(ssGSEA低分)相当(由此可知B)。

由此可知S5.与但会运动量的病征相比,很低血压病征的膀胱周碳水化合物推断出发炎和减压减少

综上,在COMPARZ试验缓冲区中都,经过IMDC很低风险低分调整后,推断出近似于但会运动量病征,丝氨酸趋化因子衍生物疗法提很低了很低血压病征的生存环境率,特别是放弃sunitinib疗法的病征。IMDC很低风险低分模型包含的组分间接反映宿主因素对胰脏症系统性发炎起到(举例如贫血,中都性粒巨噬细胞增多,和粒巨噬细胞增多症),这些因素可能也是免疫疗法结果和BMI二者之间关联选择性的原因。推断出很低血压病征的甲状腺转化分数很低于但会运动量病征,与之前其他的科学研究结果表明的,参与甲状腺转化,β-氧化简而言之等等基因序列的钼的自然现象保持一致。因此,甲状腺转化的歧异可以部分理解很低血压病征放弃丝氨酸趋化因子衍生物疗法后的较好预后。

此科学研究为很低血压悖论提供了免疫学支持。在患有ccRCC的病征观察到很低血压病征近似于但会运动量的病征微环境的歧异:特别是很低血压病征的的甲状腺转化减少,但相相当发炎无明显歧异。值得注意的是很低血压病征的远处碳水化合物推断减少的发炎和减压状况。光亮巨噬细胞胰脏与疣周腺体微环境的精细化学键可能有着临床研究意义,值得进一步科学研究。

原始记事:

Sanchez A, Furberg H, Kuo F, Vuong L, Ged Y, Patil S, Ostrovnaya I, Petruzella S, Reising A, Patel P, Mano R, Coleman J, Russo P, Liu CH, Dannenberg AJ, Chan TA, Motzer R, Voss MH, Hakimi AA. Transcriptomic signatures related to the obesity paradox in patients with clear cell renal cell carcinoma: a cohort study.Lancet Oncol. 2020 Feb;21(2):283-293

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